教会纪律是具有属灵性质的，是作为天国钥匙之一赐给教会，用以关闭或开放天国之门的。因此，长老会应确保用它惩罚干犯纯全教义和敬虔生活的罪，目的是使罪人与神、教会及邻舍和好；也使一切过犯从基督教会中被除去。长老会使用教会纪律时当顺服、遵守我主在马太福音第18章第15-17节中的诫命。